2021년 서울~양평고속도로 사업은 종점을 경기 양평군 양서면으로 하는 노선으로 예비타당성 조사를 통과했다. 그런데 윤석열 정부 출범 이후인 2023년 5월, 국토교통부가 종점을 김건희 여사 일가의 선산·토지가 있는 강상면으로 변경하는 대안 노선을 검토하고 있다는 사실이 알려지며 특혜 의혹이 불거졌다. 논란이 커지자 원희룡 당시 국토부 장관은 같은 해 7월 "김건희 여사 땅이 거기 있었다는 것을 이 사건이 불거지기 전에 조금이라도 인지했다면 저는 장관직을 걸 뿐만 아니라 정치 생명을 걸겠다"며 사업 전면 백지화를 선언했다. 백지화 선언 당시 국토부는 노선 검토 자체가 교통수요·환경훼손 최소화를 고려한 정상적 절차였다는 해명자료를 냈다.
이 사건은 2026년 김건희 특검(민중기)의 1차 수사에서 국토부 서기관 등 7명이 노선을 강상면 종점으로 유도한 혐의로 기소되며 실체 규명이 시작됐다. 이후 원희룡 전 장관의 역할을 겨눈 2차 종합특검(권창영 특별검사)이 수사를 이어받았다. 특검은 백지화 선언 당시 국토부가 "선언 과정에 법 위반 소지가 있다"는 법률 자문을 이미 받아놓고도 "위반 소지가 없다"는 보도자료를 낸 사실, 그리고 국토부 해명자료 작성에 대통령실이 직접 개입한 정황(국토부 서기관 진술: "대통령실에서 보도자료를 작성해 내려온 것으로 기억한다")을 확보했다고 밝혔다. 원 전 장관이 내부 회의에서 "대안 노선으로 가면 수사를 받을 수 있다"는 취지로 발언했다는 국토부 관계자 진술도 나왔다 — 특검은 이를 종점 변경의 위법성을 원 전 장관이 어느 정도 인식하고 있었다는 정황으로 보고 있다.
특검의 원 전 장관 출석 요구서는 두 차례 모두 폐문부재로 송달되지 않았다. 2026년 7월 17일 특검은 원 전 장관을 출국금지했고, 이 글을 쓰는 시점(7월 15~17일 사이) 신체와 차량에 대한 압수수색을 실시해 휴대전화를 확보했으며 직권남용 권리행사방해 혐의 피의자로 적시했다. 원 전 장관은 특검 수사에 대해 "온 나라를 1년 내내 요란하게 만들더니 수사 종료를 앞둔 지금 나온 게 도대체 뭔가", "1년 동안 출국을 금지한 채 주변 사람들을 다 괴롭히고 어마어마한 범죄가 있는 것처럼 떠들다가 털어봐야 먼지 하나 없으니 이런 모욕 주기식 언론 플레이로 빈손을 덮으려는 것 아닌가"라며 반발했다.